Découvrir Besançon et, en même temps, compléter ses connaissances sur l'évolution du monde animal, ne sont pas des ambitions contradictoires, grâce à ce musée où vous parcourrez un insectarium (fourmilière, mygales, phasmes...), l'aquarium (faune aquatique des rivières, de la truite au silure), le parc zoologique (dont des espèces menacées) et le noctarium où vous tomberez nez à nez avec des mulots et des rats d'égout.