Le musée du Temps présente toutes sortes d'objets de mesure du temps et de l'espace. Car, après s'y être implantée en 1793, l'horlogerie est devenue l'activité principale de Besançon jusqu'aux années 1920. À l'aide d'une muséographie interactive, on remonte à l'invention du pendule (1657), au passage à l'horlogerie mécanique, puis électronique. On s'intéressera aussi au pendule de Foucault et au perfectionnement de la montre « aux 24 complications » fabriquée en 1904.