Le musée renferme des collections très variées : objets préhistoriques, pièces de l'Antiquité grecque, argenterie bernoise, oeuvres profanes et sacrées d'Asie et d'Océanie et tapisseries de Bourgogne (1440-1515). Remarquez le salon de Pourtalès et la balance géante. Depuis 2010, le bâtiment abrite également l'unique musée au monde dédié à Einstein. Expositions temporaires.